Jízdní řády – IDOS Rychlíky a Expresy vozí České dráhy na základě objednávky Ministerstva dopravy, osobní a spěšné vlaky objednávají jednotlivé krajské úřady. Ministerstvo a kraje také určují počty spojů i jejich časové polohy. Vlaky SuperCity Pendolino pojedou o do Ostravy o 7 minut rychleji. Jeden pár bude převeden do kategorie InterCity. Přímé rychlíky Brno – Hradec Králové jsou přesměrovány na trasu Brno – Praha, spojení do Hradce Králové bude nově s přestupem v Pardubicích. V úseku Praha – Česká Třebová tak vznikne hodinový takt rychlíků. Na jižní Moravu pojedou z Prahy dva nové expresy: „Šohaj“ do Veselí nad Moravou (odjezd z Prahy 9:06) a „Mojmír“ do Luhačovic. Dálkové vlaky na trase Bohumín – Ostrava – Přerov – Brno budou jezdit v hodinovém taktu (kromě jedné výjimky dopoledne a dvou výjimek o víkendech) a budou sestaveny z modernizovaných vozů ve větším rozsahu, než dosud. Každý druhý nebude zastavovat ve Studénce, Suchdole nad Odrou a Hranicích na Moravě. Mezi Ostravou-Svinov a Opavou budou jezdit rychlíky v dvouhodinovém taktu, z Opavy budou pokračovat střídavě do Jeseníku a do Olomouce. Krajské úřady objednaly v naprosté většině případů v podstatě stejný objem vlaků, jako v právě končícím jízdním řádu. O 6% méně vlaků vyjede v Ústeckém kraji, naopak v kraji Jihomoravském přibude 5% spojů. Od roku 2008 bude stát investovat po dobu tří let až trojnásobné částky do obnovy železniční infrastruktury, proti dosavadnímu stavu. Bude probíhat celá řada výluk, které ovlivní také spoje Českých drah.